En erkendelse af, at landbrugsdriften år 1900 formentlig ikke som tidligere antaget havde en meget lav kvælstofudvaskning medførte i begyndelsen af 2020, at en gruppe forskere på Aarhus Universitet, med ansvaret for måltallene i vandplanerne, forkastede tallene, som efter en præsentation på Plantekongressen 2020, blev lagt i skuffen. Det til trods for, at de var tiltænkt en hovedrolle i Vandplan 3. Den 6. januar 2020 fremkom DCE således med et rådgivningsnotat, hvor det anførtes, at DCE ikke mener at år 1900 danner et validt referencegrundlag:
"Tilførslerne i år 1900 kan derfor ikke betragtes som en referencetilførsel sensu VRD og kan som følge deraf ikke anvendes til beregning af referencetilstand for f.eks. klorofylindikatoren i kystvandene til brug for Vandplan 3," står der i notatet.