Ved intern smittebeskyttelse tilstræbes det, at der ikke overføres smittestoffer mellem grupper af svin inden for besætningen, og fra personer, som arbejder i besætningen til besætningens dyr. Smittebeskyttelse er særdeles vigtig for at sikre besætningen bedst muligt mod tab som følge af sygdomme, der introduceres og spredes rundt i besætningen.
Men hvad bruges af ressourcer på at forebygge sygdomme i besætninger i praksis? Ofte begrænser det sig til at vaske støvler en gang om dagen.