Svineproduktion er naturligt forbundet med produktion af husdyrgødning - ofte gylle, som anvendes til gødskning af afgrøder.
Gødskningen vanskeliggøres af rågyllens skæve indhold af kvælstof og fosfor. Svinegyllen indeholder "for meget" fosfor i forhold til planternes behov, og rågyllens indhold af organisk bundet kvælstof er ikke umiddelbart til rådighed som plantenæring. Rågyllens værdi som gødning forbedres, når det i et biogasanlæg udsættes for anaerob forgæring.